Si bien el departamento de puno exhibe mejoras sustanciales en la cobertura y la tasa de conclusión de sus alumnos en los niveles básicos de educación, todavía existe una parte importante de la población desatendida, sobre todo en el medio rural. En el 2011 se registraron 364,084 alumnos matriculados, así como 22,758 docentes, de los cuales el 86.3% laboraba en el sector público. En el mismo periodo se censaron 5,604 centros educativos (escolarizados y no escolarizados); de ellos 1,934 brindaron educación primaria y 556 educación secundaria. El resto ofrecía educación en otros niveles.
Puno presenta cifras por debajo del promedio nacional en cuanto a aprendizajes adecuados en comprensión de textos y matemática, con 19.5% y 7.6% respectivamente. Asimismo, el atraso escolar -alumnos que cursan estudios fuera de su edad adecuada para el grado o nivel- es un problema regional, aunque se están mostrando cifras cada vez más alentadoras. Por ejemplo, en el nivel primaria el 7.9% de los alumnos está atrasado (el promedio nacional es de 10.8%). Esta cifra se agrava en secundaria, con 15.4% (el promedio nacional es de 14.8%). De otro lado, Puno es el quinto departamento con mayor tasa de analfabetismo, según cifras del PRONAMA, y tiene dos provincias que registran una tasa mayor al 10% de analfabetismo en su población. Se debe tomar en cuenta para los programas educativos la multiculturalidad de Puno, que tiene población de habla quechua y aimara.
Puno cuenta con tres universidades, una de ellas estatal. Al 2010, la población universitaria fue de 41,308 alumnos de pregrado y 4,307 de posgrado.
Gasto público en instituciones educativas por alumno (2011)
En Puno, el gasto público por alumno del 2011 ha estado por encima o cerca del promedio nacional en todos niveles. El gasto en infraestructura y equipamiento está elevando poco a poco la cobertura y la calidad educativa en la región.
Perfil educativo (2011 - 2012)
Puno ha logrado importantes avances en la cobertura educativa en los tres niveles básicos, pero debe asegurar aún la conclusión adecuada de los estudios, sobre todo en secundaria.
Matricula escolarizada (2011)
La provincia de San Román, principal polo comercial del departamento, concentra una mayor población y tuvo el 23% del total de matrículas. Le sigue Puno 17.6% y Azángaro con 11.9%.
Tasa de analfabetismo de Puno
La cifra proyectada por PRONAMA, con base de datos del primer semestre del 2011 es de 5.12%. El censo del 2007 indico 10.8% de analfabetismo. La estimación del INEI para el 2011, hecha a partir del censo, fue de 11.1%.